شهید میکاییل ‌بخشی خانقاه در پانزدهم فروردين ماه 1367، در منطقه مريوان توســط نيروهاي عراقي بــر اثر اصابت تركش به پا، شهيد شــد. مزار وي در گلزار شــهداي علي‌آباد شهر اردبیل واقع است.