شهید بابا بابایی در هجدهم فرورديــن ماه 1366، با ســمت تك‌تيرانداز در شــلمچه بر اثر اصابت تركش به سر، شهيد شد. مزار وي در گلزار شهداي قاسميه شهر اردبيل واقع است.